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2025年1月
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成功案例
項目背景
2016年,中國精準醫(yī)療計劃正式啟動,旨在應用現(xiàn)代遺傳技術(shù)、分子影像技術(shù)、生物信息技術(shù),結(jié)合患者生活環(huán)境和臨床數(shù)據(jù),籌建中國人群全基因組數(shù)據(jù)庫和樣本庫,實現(xiàn)精準的疾病分類和診斷,并能夠制定具有個性化和針對性的預防治療方案。
首都醫(yī)科大學附屬北京天壇醫(yī)院是世界三大神經(jīng)外科研究中心之一、亞洲神經(jīng)外科臨床、科研、教學基地。天壇醫(yī)院腦神經(jīng)領(lǐng)域在世界享有盛名,率先啟動了腦血管病精準醫(yī)學的研究,包括腦血管病精準醫(yī)學隊列、腦血管病發(fā)病和預后的組學研究、腦血管病藥物基因組研究及腦血管大數(shù)據(jù)研究等。為了滿足前沿科研的計算模型需求,天壇醫(yī)院啟動了面向高通量基因組學數(shù)據(jù)處理與智能病理影像識別系統(tǒng)建設(shè)(以下簡稱:基因組學系統(tǒng))。
用戶需求
天壇醫(yī)院基因組學系統(tǒng)將用于臨床實驗與研究中心診療信息、組學數(shù)據(jù)及高分辨影像數(shù)據(jù)的存儲、處理和運算;神經(jīng)系統(tǒng)單基因病診斷中心每年三千例患者DNA檢測數(shù)據(jù)的處理和分析。為國家神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學研究中心提供數(shù)據(jù)分析,滿足醫(yī)學數(shù)據(jù)智能輔助診斷系統(tǒng)和全國性組學數(shù)據(jù)庫建設(shè)需求。
基于基因組學系統(tǒng)的建設(shè)目標,存儲系統(tǒng)具備較高的聚合讀寫帶寬,為基因組測序等應用提供100G以上的高速存儲網(wǎng)絡,滿足基因數(shù)據(jù)處理與運算需求;精細化的權(quán)限管理功能,可向國家中心提供數(shù)據(jù)管理服務,同時提供可視化界面,方便用戶的配額管理;臨床數(shù)據(jù)作為該中心的核心數(shù)據(jù),價值極高,要求存儲系統(tǒng)具備高可靠性,以保障數(shù)據(jù)安全。
解決方案
曙光公司憑借多年在生物基因領(lǐng)域積累的經(jīng)驗,打造生物基因行業(yè)云存儲解決方案。曙光ParaStor分布式存儲系統(tǒng)作為該系統(tǒng)的存儲資源。曙光ParaStor聚合帶寬40GB/s以上,100Gb/s EDR Infiniband高速存儲網(wǎng)絡,解決生物基因應用中對海量大文件存儲場景高聚合帶寬、小文件存儲場景高IOPS的存儲需求。
此外,ParaStor面向云桌面系統(tǒng)提供10Gb/s 以太網(wǎng)存儲網(wǎng)絡,保證生物數(shù)據(jù)的高效共享。ParaStor系統(tǒng)支持NIS,Microsoft Active Directory,LDAP等權(quán)限管理功能,可以與用戶原有權(quán)限管理系統(tǒng)整合,保障數(shù)據(jù)共享過程中全程掌控。支持5種不同的配額類型,并提供便捷的配額管理界面,方便用戶配額分配。
基因研究產(chǎn)生的數(shù)據(jù)速度增長極快,曙光公司ParaStor分布式存儲系統(tǒng)可通過性能與容量的線性增長,滿足對存儲系統(tǒng)數(shù)據(jù)處理能力和擴展性的要求。
ParaStor分布式存儲系統(tǒng)通過多種技術(shù)手段,從物理底層到邏輯層全方位保證存儲系統(tǒng)高可靠性和高可用性,為臨床數(shù)據(jù)的存儲、管理、應用和共享保駕護航。
客戶收益
在曙光公司的幫助下,天壇醫(yī)院完成了基因組學系統(tǒng)建設(shè),為“臨床資源深度分析、挖掘和共享”提供了可靠的技術(shù)保障,也為醫(yī)學數(shù)據(jù)智能輔助診斷系統(tǒng)和全國性組學數(shù)據(jù)庫的建設(shè)奠定了堅實的基礎(chǔ)。