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2025年1月
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成功案例
疫情在全球肆虐,目前仍反復(fù)不定。針對新冠的應(yīng)急特效藥研制進(jìn)程,成為大眾關(guān)注的焦點(diǎn)。
近日,羅海彬教授牽頭,發(fā)展了藥/靶親合力精準(zhǔn)預(yù)測方法,通過并行計算效率優(yōu)化,大大加速了藥物研發(fā)從實驗室走向臨床的速度,并成功創(chuàng)制新冠肺炎應(yīng)急藥物雙嘧達(dá)莫,取得較好的臨床效果。
先進(jìn)計算助力藥物設(shè)計速度提升30倍
提升藥/靶親合力預(yù)測能力是藥物設(shè)計的核心問題。基于商業(yè)軟件的傳統(tǒng)藥物設(shè)計方法,不僅預(yù)測范圍有限,更因許可限制等原因,導(dǎo)致預(yù)測速度緩慢。
疫情之下,速度為王!基于曙光等先進(jìn)計算平臺,羅海彬教授團(tuán)隊首次通過自主開發(fā)的基于自由能微擾藥/靶親合力精準(zhǔn)預(yù)測軟件系統(tǒng),創(chuàng)制新冠應(yīng)急藥物,將單化合物預(yù)測周期縮短至1-2天! 對比傳統(tǒng)自由能微擾FEP方法所需要的1-2月/化合物的時間,其速度提升了30-60 倍!
研究對比出爐,三周治療臨床效果“7:3”!
目前,通過自主軟件加速創(chuàng)制的雙嘧達(dá)莫,已從實驗室走向了臨床(154例新冠患者),對比“阿比多爾”的11天平均出院時間,雙嘧達(dá)莫與阿比多爾合用的平均出院時間為7天,提前了4天!
同時,根據(jù)臨床對比,通過自主軟件研發(fā)的應(yīng)急藥物改善了新冠患者的凝血功能。以重型患者三周治療結(jié)果取樣,雙嘧達(dá)莫組出院比例達(dá)到了87.5%,而同期對照組出院比例僅33.3%。
先進(jìn)計算,將戰(zhàn)“疫”進(jìn)行到底
此次研究,以先進(jìn)的計算技術(shù)為支撐,以自主開發(fā)的軟件為依托,將為下次疫情來臨,提供了一個成功的應(yīng)急藥物研發(fā)模式。
除了應(yīng)急藥物研發(fā),先進(jìn)計算在戰(zhàn)疫中還有許多貢獻(xiàn)。去年伊始,疫情突如其來,曙光迅速投入到科技戰(zhàn)疫中。2020年1月初,國家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心發(fā)布新型冠狀病毒資源庫,助力科研人員開展新型冠狀病毒基因組變異分析,該中心計算資源由中科曙光提供。
同時,曙光啟動國家重點(diǎn)科研機(jī)構(gòu)先進(jìn)計算算力應(yīng)急需求保障計劃,宣布向科研界免費(fèi)提供超100PFlops(十億億次每秒)計算力資源,助力新冠肺炎防治科研攻關(guān);已為華中科技大學(xué)、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)、中國科技大學(xué)等18家單位提供2000多節(jié)點(diǎn)的免費(fèi)計算資源,有力地支持了新冠病毒相關(guān)的基因和基因組研究、病毒作用機(jī)理、病毒結(jié)構(gòu)演變機(jī)理、藥物機(jī)理研究、藥物篩選、傳染擴(kuò)散和新冠重癥病人預(yù)警的研究工作。
未來,曙光將投入更多資源與力量,將這次科技戰(zhàn)“疫”進(jìn)行到底。